| Direktur Riset dan Inovasi | Prof. Dr. apt. Elfahmi, S.Si., M.Si. |
| Deputi Direktur Bidang Riset dan Diseminasi | Nur Ahmadi, S.T., M.Eng., Ph.D. |
| Deputi Direktur Bidang Pengembangan Pusat/Pusat Penelitian/ Pusat Unggulan Ilmiah | Dr. Grandprix Thomryes Marth Kadja, M.Si. |
| Deputi Direktur Bidang Inovasi Sains dan Teknologi | Dr.Eng. Isty Adhitya Purwasena, S.Si., M.Si. |
| Kepala Subdirektorat Program, Monitoring, dan Evaluasi | Noviyanti, A.Md., S.M. |
| Kepala Subdirektorat Keuangan dan Anggaran | Raditya Panji Birama, A.Md., S.E. |
| Kepala Subdirektorat Sarana, Prasarana, dan Sistem Informasi | Housny Mubarok, S.T. |
| Kepala Seksi Monitoring dan Evaluasi Program Riset dan Inovasi | Nia Nuraeni, S.Pd. |
| Kepala Seksi Monitoring dan Evaluasi Pusat/Pusat Penelitian/PUI | Efson Thrismono, M.Pd. |
| Kepala Seksi Administrasi Anggaran | Fera Setiawati Nurhayati, A.Md. |
| Kepala Seksi Konsolidasi dan Pelaporan Keuangan | Dyah Anita Setyawati, S.E. |
| Kepala Seksi Sarana dan Prasarana | Antonius Setiono Hadi Mujiran, A.Md. |
| Kepala Seksi Data dan Sistem Informasi | Suyanto, A.Md. |
| Kepala Seksi Pengelolaan Jurnal dan Non Jurnal | Yuliah Qotimah, M.T. |
| Kepala Sekretariat | Indah Rusdianti, S.E. |